Donc après un petit moment de panique, je reprend mes esprit. J’opère à des netoyages :
retirer toutes les trasparence (en les replaçant par la couleur qui correspond pour garder le même rendu)
retirer tous les masques et les remplacer par des exports croppé à la bonne taille
Et en suite le script ultime (enfin pour moi hein)
gs -dSAFER -dBATCH -dNOPAUSE -dNOCACHE -sDEVICE=pdfwrite -sColorConversionStrategy=CMYK -dProcessColorModel=/DeviceCMYK -sOutputFile=output-cmy.pdf input-rgb.pdf
source : http://stackoverflow.com/questions/6241282/converting-pdf-to-cmyk-with-identify-recognizing-cmyk
Bref, j’ai fini par avoir un BAT qui m’allais, au bout de 24h d’aller retour, de bidouillage et de lecture de forum...